โรคติดเชื้อไวรัสนิปาห์ ผู้ป่วยที่ติดเชื้อจะมีอาการเริ่มแรกคล้ายไข้หวัด มีไข้สูง ปวดตัว ปวดเมื่อยกล้ามเนื้อ คลื่นไส้ อาเจียน มีผู้ป่วยบางรายที่พบอาการของระบบทางเดินหายใจร่วม นอกจากนี้ยังอาจมีอาการไข้ร่วมกับอาการทางระบบประสาท เช่น วิงเวียนศีรษะ ซึม สับสน การทรงตัวมีปัญหา